1.中華民國 54  年 7  月 9  日經濟部經台（54）經加字第 13950 號令訂定
  發布全文 46 條
2.中華民國 64  年 3  月 26 日經濟部經（64）法 06681 號令修正
  發布名稱及全文 87 條
3.中華民國 72  年 4  月 11 日經濟部（72）技 13556  號令修正
  發布第 9、20、34、36、40、41、43、45～47、50、51、58、65
  、67～69、74、78、82 條條文；刪除第 8 條條文，並增訂第 47
  條之 1 條文
4.中華民國 74  年 8  月 5  日經濟部經（74）技 33341 號令修正
  發布第 6、7、10、12、16、21、27、45、56、59、65～68、70、
  78、79、83 條條文；刪除第 31 條條文，並增訂第 10 條之 1、
  10 條之 2 及 53 條之 1 條文
5.中華民國 77  年 5  月 13 日經濟部經（77）技 13091  號令修正
  發布第 12、14～16、21、41、45～47、49～52、53 條之 1、58、
  74～78、80 條；並刪除第 39、81 條條文
6.中華民國 79  年 3  月 26 日經濟部經（79）技 012652 號令修正
  發布第 4、5、36、38、40、42、45～47、49、51、53、53 條之 1
  、62、65～70、77 條文；增訂第 3 條之 1、10 條之 3、10 條之
  4 條文；並刪除第 30、50、83 條條文
7.中華民國 83  年 4  月 27 日經濟部（83）經加字第 083925 號令修正
  發布全文 83 條
8.中華民國 85  年 1  月 17 日經濟部（85）經加字第 84462473 號令修正
  發布第 50 條條文
9.中華民國 87  年 7  月 8  日經濟部（87）經加字第 87460953 號令修正
  發布全文 74 條
10. 中華民國 89  年 5  月 19 日經濟部（89）經加字第 89315094 號令修正
    發布第 38、39、45、48、49、50、51、53、55、56、57、60 條條文；並
    刪除第 11、35、44、46、47、59 條條文
11. 中華民國 91  年 7  月 3  日經濟部經加字第 09104615340  號令修正
    發布全文 99 條；並自發布日施行
12. 中華民國 92  年 10 月 15 日經濟部經加字第 09204612220  號令修正
    發布第 57 條條文
13. 中華民國 94  年 2  月 25 日經濟部經加字第 09404601500  號令修正
    發布第 3、4、6、11、14、17、23、36、39、55、58、73～76、79 條條
    文；增訂第 23 條之 1、84 條之 1 條文；並刪除第 7、8 條條文
14. 中華民國 94  年 10 月 6  日經濟部經加字第 09404608150  號令修正
    發布第 27、28、31、57、67、75 條條文；並刪除第 29 條條文
15. 中華民國 96  年 1  月 24 日經濟部經加字第 09604600090  號令修正
    發布全文 42 條；並自發布日施行
16. 中華民國 96  年 11 月 8  日經濟部經加字第 09604605170  號令修正
    發布第 11～13 條條文
17. 中華民國 98  年 6  月 8  日經濟部經加字第 09804602680  號令修正
    發布第 12、21、42 條條文；除修正之第 12 條條文，自 98 年 1 月 1
    日施行者外，自發布日施行
18. 中華民國 102 年 9  月 14 日經濟部經加字第 10204604890  號令修正
    發布第 16 條條文
19. 中華民國 107 年 10 月 30 日經濟部經加字第 10704605580  號令修正
    發布第 15、24、30、31、33～36、38 條；並刪除第 39 條條文
20. 中華民國 110 年 5  月 3  日經濟部經加字第 11004601960 號令修正
    發布第 1、3、4、7、9、10、18、19、29～32、34、42 條條文及第四
    章章名；刪除第 2、23 條條文；並自發布日施行
    中華民國 112 年 9  月 13 日行政院院臺規字第 1121031987 號公告
    第 3 條、第 4 條、第 5 條第 1 項、第 3 項、第 6 條、第 9 條第
    1 項序文、第 10 條第 4 款、第 11 條第 1 項、第 2 項、第 12 條
    第 1 項、第 2 項、第 13 條第 1 項、第 2 項、第 14 條、第 15
    條、第 16 條第 1 項、第 3 項、第 17 條、第 19 條、第 20 條、
    第 21 條、第 25 條第 2 項、第 26 條、第 27 條、第 29 條、第
    30 條、第 32 條第 1 款、第 34 條第 1 項、第 2 項 、 第 35 條
    、第 36 條本規則名稱及各該規定所列屬「經濟部加工出口區管理處
    」、「經濟部加工出口區管理處各分處」之權責事項，自 112 年 9
    月 26 日起改由「經濟部產業園區管理局」、「經濟部產業園區管理
    局各分局」管轄
21. 中華民國 112 年 11 月 6  日經濟部經園字第 11255600380 號令修正
    發布名稱及全文 39 條；並自發布日施行（原名稱：加工出口區管理處
    及分處業務管理規則）